Reference

• cellmaps_ppi_embedding package
  • Submodules
  • cellmaps_ppi_embedding.cellmaps_ppi_embeddingcmd module
    • main()
  • cellmaps_ppi_embedding.exceptions module
    • CellMapsPPIEmbeddingError
  • cellmaps_ppi_embedding.runner module
    • CellMapsPPIEmbedder
      • CellMapsPPIEmbedder.PPI_EDGELIST_FILEKEY
      • CellMapsPPIEmbedder.generate_readme()
      • CellMapsPPIEmbedder.get_apms_edgelist_file()
      • CellMapsPPIEmbedder.get_ppi_embedding_file()
      • CellMapsPPIEmbedder.run()
    • EmbeddingGenerator
      • EmbeddingGenerator.DIMENSIONS
      • EmbeddingGenerator.get_dimensions()
      • EmbeddingGenerator.get_next_embedding()
    • FakeEmbeddingGenerator
      • FakeEmbeddingGenerator.get_next_embedding()
    • Node2VecEmbeddingGenerator
      • Node2VecEmbeddingGenerator.NUM_WALKS
      • Node2VecEmbeddingGenerator.P_DEFAULT
      • Node2VecEmbeddingGenerator.Q_DEFAULT
      • Node2VecEmbeddingGenerator.WALK_LENGTH
      • Node2VecEmbeddingGenerator.WORKERS
      • Node2VecEmbeddingGenerator.get_next_embedding()
  • Module contents